LitSense. ¡Nueva herramienta para la búsqueda semántica en PubMed y PMC!

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Nos acabamos de enterar de la puesta en marcha de LitSense una nueva herramienta gratuita, fruto de un proyecto de investigación* respaldado por la National Libray of Medicine (NLM). Es un sistema de búsqueda único en la literatura biomédica, que permite la búsqueda semántica, es decir que recupera documentos a nivel oración en lugar de a nivel artículo. 

¿Dónde busca?

LitSense busca en los más de 36 millones de resúmenes de PubMed y en los casi 3 millones de artículos de PubMed Central de acceso abierto.

¿Cómo funciona en 5 pasos?

  1. LitSense sólo muestra oraciones que tengan al menos un 60% de términos similares al de nuestra consulta. Cando este porcentaje no se produce la base de datos muestra los resultados del 30% de coincidencia. Una línea vertical a la izquierda de cada documento, indica el grado de coincidencia: Naranja (alto) Verde (moderado) y azul (bajo)
  1. El cuadro de la derecha denominado BioConcepts permite identificar y filtrar por colores los términos que nos interesen. Además, cuando su algoritmo (PubTator) los identifica de forma automática, los presenta en el resumen en su color correspondiente, ej. las enfermedades en naranja, los genes en morado, etc.

  2. Los resultados se pueden filtrar también por las diferentes partes del documento: Título, abstract, métodos, discusión, etc. y por años.

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4. Busca por coincidencia y por significado, recuperando tanto artículos que contiene la frase exacta, como los que semánticamente son similares. Al pinchar sobre ellos se muestra el “párrafo” donde aparecen los términos de nuestra búsqueda en negrita.

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5. Si necesitamos que alguna parte de la consulta sea obligatoria, podemos utilizar las comilla


(*) Alexis Allot, Qingyu Chen, Sun Kim, Roberto Vera Alvarez, Donald C Comeau, W John Wilbur, Zhiyong Lu, LitSense: making sense of biomedical literature at sentence level, Nucleic Acids Research, Volume 47, Issue W1, 02 July 2019, Pages W594–W599.

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